改进的质粒图由snapgene提供动力

在会议中，在Twitter上的调查 - 我们有一件事从我们的用户中听到了一件事：“请改善您的质粒地图！“经过周到的设计，审查和调整后，我们很高兴地宣布，我们的质粒和序列显示器现在由GSL Biotech提供支持Snapgene.服务器软件。随着Snapgene序列查看器软件和广泛的特征库的支持，我们更新的质粒和序列显示器现在更易于解释和分析。快速看看有多少事情有所改进，请查看下面的示例。我们的旧地图位于右侧Snapgene Powered Map（点击此处查看新地图。继续阅读以了解更多关于我们实施的改进以及它们如何让您更容易找到所需的质粒。在此初始发布后，我们将在此初始启动后进一步监控和改进地图，以便保持调整以获取更多更新。

addgene的Cancgene动力质粒图概述

三个因素使我们的Syngene动力质粒图更易于导航。这些实际和有效的变化将使您能够找到具有快速所需功能的质粒。

1. Snapgene的特色库 -Snapgene的软件无缝识别各种常见的质粒特征，例如抗生素抗性基因，可选择标记，启动子那起源那标签和某些orfs。它们复杂的检测算法容易且精确地识别不同少核苷酸的质粒特征，例如荧光蛋白EGFP和MEGFP。vwin德赢娱乐平台其中许多功能，如Cas9.那我们的内部软件无法检测到。事实上，Snopgene的特征库包括近3倍，因为我们的内部软件可以检测到许多功能，并且还消除了许多杂乱的多种ORF，这些ORF杂乱了我们的旧质粒图。
   
   
2. 明确注释的特征，酶和引物 -新地图具有直接标记在其上的大多数功能的身份，使其更容易快速识别。
   
   
3. 改善限制酶处理 -Snapgene的软件位置限制酶在位置的整个地图上的注释更好地对准质粒内的精确位置。可以检测的酶列表比我们先前的映射软件大5倍，现在包括常用的IIS限制酶，其通常用于金门克隆或用于CRISPR GRNA克隆。

通过这种功能展示，您可以开始思考您的下一个克隆实验早期。

除了这些简单但强大的显示改进之外，当您单击任何质粒图时，您还可以下载静态图像文件（PNG，见上文）以供您自己的参考或直接粘贴到您的笔记本中。这将使您更容易与同事共享质粒信息，或者当您不在您的计算机时向实验室成员解释质粒特征。

地图，序列和可下载的.gb＆.dna文件

一旦确定了您想要了解更多信息的质粒，我们的序列分析仪的更新将允许您进入细节。单击“查看所有序列”按钮以查找所有可用的序列信息加入储层器以及我们自己的测序结果：

在此页面上，您可以下载注释Genbank文件或列出序列的Snapgene文件。然后，您可以分析序列查看器中的序列。如果存款人提供了自定义注释的GenBank文件，则可以在“资源信息”部分下的主质粒页面上找到。

分析你的质粒序列

对于更直接的高级别分析，您可以直接在“分析序列”按钮上单击以提出由Snapgene提供支持的交互式质粒贴图，并获得访问其他工具提示信息和序列分析选项卡，包括：

• 地图

• 在单击“分析序列”按钮后，这是您将降落的第一个选项卡。托管的地图保留了上面讨论的静态地图中显示的所有功能，但也具有交互功能。您现在可以悬停在任何特征，酶，底漆或ORF上，以了解有关它的更多信息。例如，如果你悬停在氨苄青霉素上抗性基因，您会发现基因的全名，其基因产物的名称，以及其功能的描述。您还可以单击质粒中的一个位置，然后单击一个位置，然后选择第二个位置以在两个位置之间选择序列，并将其发送到剪贴板以进行复制和粘贴功能。
  

• 顺序

• 类似于质粒图，这里托管的线性序列现在是交互式的并且在特征上具有类似的悬停。与地图选项卡一样，单击线性序列中的两个单独位置选择两个位置之间的序列，并将其发送到剪贴板以进行复制和粘贴功能。
  

• 限制酶

• 在这里，您可以找到切割给定序列的限制酶表。该表包括酶名称，酶将切割的位置（在底座上），以及它们切割的总次数。使用右侧的过滤器查找单个，双和3+刀具。您还可以通过单击列头来排序酶。单击特定限制酶在此处也将其突出显示在“地图”和“序列”选项卡中。
  

• 特征

• 在此发现的表列出了质粒序列中检测到的常见特征。该表包括要在地图上指示它们的特征名称，位置，大小，颜色，方向（如果相关）和类型。列出的类型是标准Genbank功能类型。单击此处的特定功能还突出显示“地图”和“序列”选项卡中的功能。
  

• 底漆

• 此选项卡包含列出在给定核苷酸序列中检测到的常用引物的表。该表包括引物名称，序列，绑定站点位置，长度和方向。单击此处的特定绑定还将其突出显示在“地图”和“序列”选项卡中。
  

• 爆破

• 通过NCBI网站使用基本的本地对准搜索工具（BLAST）以确定给定序列和核苷酸（BLASTN）或蛋白质（BLASTX）序列数据库之间的相似性。另外，使用BLAST2对准定制核苷酸序列对给定序列的。看到这个博文用爆炸来验证质粒的提示。

• 分析仪指南

• 上面列出的所有标签的快速指南及其功能。

我们希望这些更新将使浏览存储库更容易，并快速识别您需要对下一次实验所需的质粒和功能。我们谨此感谢您（我们的科学家社区），以建议这些变更，以及创建的Snopgene和Addgene软件开发团队，以不知疲倦地实施这些改进。让我们知道您对下面的评论部分中的更新的看法并继续检查www.anajohnsson.com.有关其他增强功能，请进一步改进地图显示和功能。